副業くんせどりの売上が増えてきて、「仕入税額控除」とか「仕入控除税額」という言葉を見かけるようになりました。何のことか分からなくて…。自分にも関係ありますか？
消費税の話は、言葉が似ていてややこしいですよね。所得税（確定申告）とは別のしくみなので、混ざって分からなくなる人が多いところ。
この記事では、仕入税額控除のしくみを、せどり・フリマの仕入れの例で、国税庁のタックスアンサーの内容にそってまとめました。
仕入税額控除は、売上で預かった消費税から、仕入れで払った消費税を引いて納める額を決めるしくみ。差し引く金額のことを「仕入控除税額」と呼びます。
関係があるのは、消費税を納める「課税事業者」だけ。インボイス制度が始まってからは、インボイス（適格請求書）がない仕入れは原則として引けず、特例に当たらなければ経過措置で70%だけ引ける形です（2026年10月1日から）
この記事の内容は、2026年10月30日に国税庁のタックスアンサー（令和8年4月1日現在の法令等）と国税庁のお知らせで確認しています。税金の扱いは人によってちがうので、最後は税務署か税理士さんに確かめてください。
【コニシ】
物販プレイヤー兼ブロガー
中古パソコン転売で2,000台以上を販売。せどり・ネット物販歴11年、法人7期目。北海道在住、1児の父です。会社員の副業でせどりを始めた経験から、サラリーマンのためのせどり情報を書いています。
仕入税額控除とは？しくみをせどりの例でわかりやすく
国税庁の説明では、消費税の納付税額は「課税売上げに係る消費税額から…課税仕入れ…に係る消費税額を控除（仕入控除税額）して計算します」
つまり、預かった消費税 − 払った消費税 ＝ 納める消費税です。
せどりで、税込11,000円で仕入れた商品を税込22,000円で売ったとします。消費税10%で、ざっくりしたイメージはこんな感じ。
| 項目 | 金額 |
| 売ったときに預かった消費税 | 2,000円（22,000円のうち） |
| 仕入れで払った消費税 | 1,000円（11,000円のうち） |
| 納める消費税 | 2,000円 − 1,000円 ＝ 1,000円 |
この「1,000円を引ける」のが仕入税額控除で、引ける1,000円が仕入控除税額。もし引けなければ、2,000円まるごと納めることになります。実際の計算は、国の消費税と地方消費税に分けるなど、もう少し細かい手順で行います。
課税仕入れになるのは、商品の仕入れだけではありません。国税庁の例では、事業用の備品、広告宣伝費、通信費、水道光熱費、事務用品・消耗品、修繕費、外注費なども入ります。給与の支払いは入りません。
「仕入控除税額」と「仕入税額控除」のちがい
2つは似ていますが、「仕入税額控除」はしくみの名前、「仕入控除税額」は差し引く金額のことです。
| 言葉 | 意味 |
| 仕入税額控除 | 売上の消費税から、仕入れの消費税を差し引くしくみ |
| 仕入控除税額 | そのしくみで実際に差し引く消費税の金額 |
「仕入控除税額」で調べると、補助金の書類がたくさん出てきます。これは、補助金をもらった事業者が、その仕入控除税額を報告・返還する手続きの話。あとで短く説明しますね。
仕入税額控除は誰に関係ある？免税事業者なら考えなくていい
消費税を納める義務がない「免税事業者」は、そもそも消費税の申告をしないので、仕入税額控除を気にする必要はありません。
個人の場合、前々年（基準期間）の課税売上高が1,000万円以下なら、原則として免税事業者です。副業のせどりを始めたばかりの人は、ほとんどがこちらに当たります。
1,000万円以下でも課税事業者になる場合
インボイス（適格請求書発行事業者）の登録をした人、前年1〜6月（特定期間）の課税売上高が1,000万円を超えた人、課税事業者選択届出書を出した人は、納税の義務が免除されません。
取引先から「インボイスを出してほしい」と言われて登録すると、売上が少なくても課税事業者になります。登録するかどうかは、売上の規模と取引先の事情で決めることなので、税理士さんに相談するのが確実です。
仕入税額控除の要件｜帳簿とインボイスの両方を7年間保存
仕入税額控除を受けるには、帳簿と、インボイスなどの請求書等の両方を保存することが条件です。保存期間は7年間（6年目と7年目はどちらか一方でOK）
インボイスは、税務署に登録した「適格請求書発行事業者」しか出せません。登録番号（Tから始まる番号）・取引年月日・内容・税率ごとの金額と消費税額などが書かれた書類です。お店のレシートでも、小売業の店が出す「適格簡易請求書」なら使えます。
Amazonや通販サイトの領収書でも、売り手の登録番号が書かれているかを見ておきましょう。海外の通販サイトの記録の扱いは、こちらでもまとめています。
海外から輸入したときは、税関の輸入許可書などに書かれた輸入消費税が対象になります。中国輸入の税金の計算は、こちら。
仕入れ値とは？仕入帳の書き方
仕入れ値は、売るための商品を買ったときの値段のこと。「仕入れ価格」も同じ意味です。買った相手のことは、仕入先や購入先と呼びます。
この仕入れの記録を日付順に書いたものが、仕入帳。1件ごとに、日付・仕入先・品名・金額の4つを書くのが基本です。
| 書く項目 | 中身 |
|---|---|
| 取引の年月日 | 買った日 |
| 仕入先（購入先） | 買った相手の名前や店名 |
| 品名（内容） | 何を買ったか |
| 金額 | 支払った金額（消費税を含む額） |
国税庁が仕入税額控除の帳簿の記載事項に挙げているのも、この4つ。軽減税率の対象の物は、その旨も書きます。
フリマ・ヤフオクの個人からの仕入れはどうなる？
せどりで困りやすいのが、メルカリやヤフオクで個人から仕入れた場合です。個人はインボイスを出せないので、原則としてその仕入れの消費税は引けません。
ただし、例外があります。どれも国税庁のタックスアンサーで案内されている取り扱い。
| ケース | 扱い |
| 古物商が、インボイス発行事業者でない人から古物を仕入れた（商品として売る物） | 一定の事項を書いた帳簿の保存だけで控除できる（古物商の特例） |
| 税込1万円未満の仕入れ（前々年の課税売上高が1億円以下などの事業者、2029年9月30日まで） | 一定の事項を書いた帳簿の保存だけで控除できる（少額特例） |
| 上に当たらない、インボイスのない仕入れ | 経過措置で一定の割合だけ控除できる（2026年10月1日から70%） |
古物商の特例は、古物営業をしている人の、商品（棚卸資産）になる古物の仕入れが対象。中古品を仕入れて売るせどりで課税事業者になるなら、古物商の許可を持っているかで扱いが変わるわけです。
帳簿だけで控除する特例を使うときは、ふだんの記載に加えて「特例に当たる旨」と「仕入れ先の住所または所在地」を書く必要があります（一部の仕入れは住所が不要）
匿名配送の取引で足りるかは、税務署か税理士さんに確かめてください。
古物商の許可については、こちら。
経過措置は80%から70%へ｜2026年10月1日からの割合
インボイスのない仕入れの経過措置は、2026年10月1日から割合が80%から70%に下がりました。国税庁のお知らせでは、その後も段階的に下がると案内されています。
| 期間 | 控除できる割合 |
| 2023年10月1日〜2026年9月30日 | 80% |
| 2026年10月1日〜2028年9月30日 | 70% |
| 2028年10月1日〜2030年9月30日 | 50% |
| 2030年10月1日〜2031年9月30日 | 30% |
| 2031年10月1日から | 控除できない |
同じ免税事業者などからの、経過措置の対象になる仕入れが年1億円を超えると、超えた分はこの経過措置を使えません（2026年10月1日以後に始まる課税期間から。それまでは10億円）
せどりの規模なら当てはまる人は少ないはずですが、覚えておくと安心です。
計算がたいへんなら｜簡易課税と2割特例・3割特例
仕入れのたびにインボイスを集めて計算するのは、正直かなり手間。売上の規模が小さい事業者には、仕入れの消費税を売上から決まった割合で計算できる「簡易課税」という方法があります。
簡易課税は、前々年の課税売上高が5,000万円以下の課税事業者が、届出書を出して選ぶ方法。仕入れの消費税を、事業の区分ごとの「みなし仕入率」で計算します。
| 事業の区分 | みなし仕入率 |
| 第1種（卸売業） | 90% |
| 第2種（小売業など） | 80% |
| 第3種（製造業など） | 70% |
| 第4種（その他） | 60% |
| 第5種（サービス業など） | 50% |
| 第6種（不動産業） | 40% |
届出は、使いたい課税期間が始まる前の日までに出すのがルール。せどりがどの区分になるかは売り方で変わるので、税務署か税理士さんに確かめましょう。
インボイスの登録で免税事業者から課税事業者になった人向けの「2割特例」（納める消費税を売上の消費税の2割にできる）は、2026年9月30日までの日を含む課税期間で終了。
かわりに、インボイスの登録で課税事業者になった小規模な個人事業者には、2027年分と2028年分に「3割特例」（納める消費税を売上の消費税の3割にできる）が設けられています。
補助金の「仕入控除税額報告書」とは？
補助金の書類に出てくる「仕入控除税額」は、補助金で買った物の消費税を、仕入税額控除で引いた分のこと。
青森県の説明資料では、補助金には消費税分も含まれているものの、税金の計算では非課税の収入として扱われるため、その消費税分が納付に使われない、と説明されています。だから仕入控除税額にあたる分の補助金を返す必要がある、というしくみ。
同じ資料では、消費税の申告義務がない場合や、簡易課税で申告している場合は返還がないとされています。ただし、返還がなくても報告そのものは求められる、という扱い。補助金ごとに要綱で決まっているので、交付元の案内を見てください。
インボイスの登録申請のやり方は？e-Taxでの手順と書き方
適格請求書発行事業者になるには、税務署に登録を申請します。個人ならスマホのe-Taxからでも申請できます。質問に答えていく形なので、紙の申請書より迷いにくいですよ。
e-Taxでは電子証明書と利用者識別番号を使います。
国税庁の「インボイス制度特設サイト」の「申請手続」から開いて、マイナンバーカードでログインします。スマホとタブレットから使えるのは個人事業者だけです。
表示される質問に「はい」「いいえ」などで答えます。登録通知の受け取り方も選びます。
送信後に受信通知が見られれば、申請は完了です。
紙の申請書で出す場合は、「課税事業者」か「免税事業者」のどちらかに必ずチェックして、次葉の「登録要件の確認」も書きます。郵送先は国税局ごとに決まっていて、インボイス登録センターの案内ページに載っています。窓口へ持ち込むことはできません。
| 提出方法 | 登録通知までの目安（2026年10月15日時点） |
|---|---|
| e-Taxで提出 | 約2か月 |
| 書面で提出 | 約2.5か月 |
登録すると、氏名が国税庁のサイトで公表されます
個人事業者は、何も申し出なければ氏名・登録番号・登録年月日が公表されます。屋号などを載せたいときは、公表の申出を一緒に送れます。
免税事業者も、登録すると消費税の申告をすることになります。課税期間の初日から登録したいなら、その初日の15日前までに申請しましょう。
仕入税額控除のよくある質問
最後に、よく出る疑問に答えておきます。免税事業者なら、まずは所得税の確定申告だけ考えればOKです。
- 副業のせどりでも仕入税額控除は関係ありますか？
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関係するのは、課税事業者になったときだけ。前々年の課税売上高が1,000万円以下で、インボイスの登録もしていなければ、原則として免税事業者なので関係ありません。
- Amazonで仕入れた物の領収書はインボイスになりますか？
-
売り手が適格請求書発行事業者で、登録番号に加えて税率ごとの金額と消費税額（どちらか一方でよい場合もあり）が書かれた領収書ならインボイスとして使えます。マーケットプレイスの出品者が登録していない場合はインボイスになりません。
- メルカリで個人から買った物は控除できますか？
-
個人はインボイスを出せないので、原則はできません。古物商が商品として古物を仕入れた場合の特例、税込1万円未満の少額特例、経過措置（2026年10月1日から70%）のどれかを使う形になります。
- 仕入控除税額はどうやって計算しますか？
-
原則は、受け取ったインボイスに書かれた消費税額を足し上げる「積上げ計算」です。売上の消費税を割り戻して計算している場合は、仕入れも支払った金額の合計から割り戻す「割戻し計算」も選べる、という決まり。
まとめ
仕入税額控除は、課税事業者になったら必ず知っておきたい、消費税を少なくするしくみです。
- 仕入税額控除＝売上の消費税 − 仕入れの消費税。引く金額が仕入控除税額
- 免税事業者（前々年の課税売上高1,000万円以下・未登録）なら関係ない
- 控除には帳簿とインボイスの両方を7年間保存する
- 個人からの仕入れは原則引けない。古物商の特例・少額特例・経過措置（今は70%）
- 計算が大変なら簡易課税。2割特例は2026年9月30日を含む期間で終了
- 最後は税務署か税理士さんに確認する
所得税の確定申告や、経費になるものはこちらでまとめました。
