せどりの棚卸しのやり方｜12月31日の在庫の数え方・評価方法・売上原価の計算例（Amazon FBA在庫も）

年末が近づくと、せどりの在庫の扱いで迷う人が増えます。棚卸しをしないと売上原価が決まらず、利益の計算が合わなくなってしまうのが困りもの。

この記事では、せどり・物販の棚卸しのやり方を、12月31日の数え方、評価方法、売上原価の計算例、棚卸表の項目の順にまとめました。

この記事の内容は、2026年11月14日に、国税庁の「令和7年分 青色申告の決算の手引き」・所得税基本通達と、e-Govの所得税法・同施行令で確認しています。申告の最終判断は、税務署か税理士にご相談を。

せどりの棚卸しは、なぜ必要？売上原価の計算

仕入れた金額が、そのまま全部が経費になるわけではありません。経費になるのは、その年に売れた分の仕入れだけ。年末に売れ残った在庫は、来年に持ち越します。

この「売れた分の仕入れ」が売上原価。国税庁は、次の算式で計算すると説明しています。

項目	意味	せどりでは
期首の棚卸高	年初（前の年の12月31日）の在庫の金額	去年の年末に数えた在庫
年間の仕入高	その年に仕入れた金額	FBA納品用の仕入れも含めた全部
期末の棚卸高	年末（12月31日）の在庫の金額	今年の年末に数える在庫
売上原価	期首＋仕入高−期末	経費になる仕入れ分

所得税法47条にも、事業の必要経費は、年末にある棚卸資産の評価額を基礎に計算する、という決まりがあります。青色か白色かは関係なく、事業所得ならこの考え方。

売上原価の計算例（売上500万円の場合）

期首の在庫が30万円、1年間の仕入れが400万円、期末の在庫が50万円のケースで計算してみましょう（金額は仮の数字）

項目	計算	金額
売上原価	30万円＋400万円−50万円	3,800,000円
売上総利益（粗利）	売上500万円−売上原価	1,200,000円

期末の在庫を数え忘れて0円にすると、売上原価が4,300,000円になり、利益は700,000円しか出ません。本当は1,200,000円なので、50万円ぶん少なく計算してしまう。

逆に、同じ売上で期末の在庫が800,000円まで増えていたら、売上原価は3,500,000円、利益は1,500,000円。年末に在庫が多いほど、その年の利益は大きく計算されます。

現金は仕入れで出ていっているのに、経費にならずに税金の計算では利益になる。在庫を抱えて年を越すと、こうなります。

棚卸しはいつ、何を数える？

棚卸しは、12月31日にするのが原則。ただ、年末が忙しくて数えられない場合は、前後の日に数えても差し支えありません。

その場合は、12月31日と数えた日のあいだの売上げ・仕入れから、12月31日の在庫を計算します。計算の方法は、あとから説明できるようにしておくこと。

商品出入帳をつけて毎日の在庫量を記録し、年に1回は実際に数えて合っているか確かめている人は、年末の実地棚卸しを省略できます。

せどりでいえば、売るために仕入れた商品が棚卸しの中心。未使用のダンボールやプチプチなどの梱包材は、通常の年と比べて特に増えていなければ、省略しても差し支えありません。

在庫の場所別・状態別の数え方

場所・状態	数え方	ポイント
自宅・手元	実際に数える（種類・状態ごと）	検品前・出品前の在庫も数える
Amazon FBA倉庫	在庫元帳レポートの最終残高で確認	売れるまでは自分の商品
出品中（フリマ）	売れていないものは在庫	売上にしたものは在庫から外す
発送中・返品中	仕入れと売上を帳簿に載せたかで判断	売上に載せていない商品は、手元になくても在庫。売上に載せたものは在庫から外す
FBAへ納品中	納品の記録で別に確認	まだ倉庫に届いていない分は、在庫元帳に出てこないことがある

仕入れと売上を帳簿に載せたルールが、在庫の数え方とそろっていることが大切。仕入れに載せたのに在庫に数えないと、売上原価がふくらんで利益が少なく出ます。

フリマは、購入・発送・受取評価の日が数日ずれます。商品の売上は、原則として「引き渡した日」に計上する決まりです（所得税基本通達36-8）

実態に合う日を選び、毎年同じ考え方でそろえましょう。

返品された商品は、売上を取り消したかどうかで、在庫に戻すかが決まります。迷うときは、税務署か税理士に確認すると安心です。

FBAの在庫は「在庫元帳レポート」で確認

Amazonは、2023年1月31日から在庫元帳レポートが、在庫スナップショットなど6つの在庫レポートの代わりになると、セラーフォーラムで案内しました。

在庫元帳は、最初の在庫残高、倉庫での受領、購入者への出荷、購入者からの返品、調整、返送や所有権の放棄、最終残高が表示されるレポート。年末の在庫の数は、この最終残高を見ます。

ほかのレポートや自分の在庫表と数字が合わないときは、同じ日付・同じSKUでそろえて照らし合わせましょう。

せどりの棚卸しのやり方｜6つの手順

やることは、表を作る・数える・確認する・金額にする・合計を書くの流れ。順番にやれば迷いません。

在庫の金額はどう決める？評価方法の選び方

在庫の金額の決め方が評価方法。届け出ていなければ、最終仕入原価法で計算します。施行令102条でも、方法を選ばなかったときはこの方法と決められています。

最終仕入原価法は、年末にいちばん近い時期に仕入れたその商品の単価を、年末の数量にかける方法。

日付	仕入れの数量	最終仕入原価法の計算（例）
4月1日	10個	1,000円
10月20日	10個	1,300円
12月31日の在庫	8個	1,300円×8個＝10,400円

この例の年末の8個は、いちばん新しい仕入れ単価の1,300円で計算。4月仕入れの安いほうが実際に残っていても、計算は1,300円のままです。

選べる評価方法と、せどりでの向き

所得税法の施行令99条では、評価方法は原価法と低価法から選びます。原価法の中身は、個別法・先入先出法・総平均法・移動平均法・最終仕入原価法・売価還元法の6つ。

方法	特徴	向いているケース（目安）
個別法	1点ごとの実際の仕入れ値で計算	中古パソコンなど1点ものが多いとき
最終仕入原価法	届出がいらない。手間が少ない	同じ商品を何度か仕入れるとき
先入先出法・総平均法・移動平均法	計算の手間が大きい	在庫の種類が少ないとき
低価法	原価法の金額と年末の価額の低いほう	青色申告の承認が前提

低価法は、青色申告の承認を受けている人だけが選べます。承認がないと、選べるのは原価法だけ。

評価方法を届け出る期限は、事業を始めた年分の確定申告の期限まで。個別法も、届け出ていなければ最終仕入原価法で計算します。

期限をすぎたあとに変えるには、税務署長の承認が必要。申請は、新しい方法を使いたい年の3月15日までに出します（2026年11月なら、2027年分の方法として、2027年3月15日まで）

どの方法が得かは、商品の値動きしだい。変更には承認が必要なので、迷うときは先に税理士か税務署へ。開業届と一緒に決める場合は、こちらも参考になります。

売れない在庫・傷んだ在庫の金額は下げられる？

国税庁の手引きには、在庫の金額を下げられるケースが書かれています。災害でひどく傷んだもの、棚ざらしや流行遅れで著しく陳腐化したもののうち、次のどちらかに当たるもの。

こうした在庫は、ほかの在庫と区別して、12月31日現在の処分可能価額で評価することもできます。処分可能価額とは、その時点で売れる見込みの金額のこと。

「売れ残っている」だけで、自動的に対象になるわけではありません。「著しく」という条件があり、状態や売れない理由しだい。迷うときは、税務署か税理士に確認を。

低価法を届け出ている青色申告の人は、原価法の金額と12月31日の価額を比べて、低いほうで評価する方法も選べます。

金額を下げた在庫は、なぜその金額にしたのか、メモを残しておくと説明できる。数量などを書いたメモは、棚卸表と一緒に保存する決まりです。

売れない在庫を持ちすぎないための考え方は、こちらの記事にまとめています。

棚卸表には何を書く？項目と記入例

棚卸表の形に決まりはありません。商品名・状態・置き場所・数量と単価・金額・備考の6つがあれば、あとから確認しやすい表になります。

項目	書くこと
商品名・型番	ASINやJANコードも書いておくと探しやすい
状態	新品・中古・訳あり
置き場所	自宅・FBA・発送中・返品中
数量と仕入れ単価	評価方法のルールで決めた単価
金額	数量×単価。合計が期末の棚卸高
備考	評価を下げた理由、数えた日

次は、商品の記入の例（数字は仮のもの）

梱包材などの消耗品は、別の表で数えます

商品名	場所	数量×単価	金額
ゲームソフトA（新品）	自宅	5個×2,000円	10,000円
ノートパソコンB（中古）	自宅	1台×18,000円	18,000円
商品C（新品）	FBA	12個×1,300円	15,600円
商品の合計（期末の棚卸高）			43,600円

棚卸しが終わったら、期首・期末の棚卸高と仕入金額を決算書に書く。青色申告と経費の全体像は、こちらの記事が参考になります。

せどりの棚卸しのよくある質問

よくある疑問を5つ集めました。評価方法の変更は承認制で、申請の期限は3月15日という点は、とくに忘れやすいところ。

副業の会社員も、棚卸しは必要ですか？

事業所得として申告する場合は、棚卸しが必要です。雑所得でも、売れた分の仕入れ（売上原価）だけが経費で、売れ残りの仕入れは経費になりません。評価方法など細かい扱いは、税務署か税理士に確認を。

在庫がゼロでも、棚卸しは必要ですか？

在庫がなければ、期末の棚卸高は0円で計算します。翌年の期首も0円。

12月31日に数えられないときは、どうしますか？

年末の前後の日に数えても差し支えありません。12月31日と数えた日のあいだの売上げ・仕入れから12月31日の在庫を計算し、その方法を説明できるようにしておきます。

評価方法は、あとから変えられますか？

税務署長の承認が必要です。新しい方法を使いたい年の3月15日までに、申請書を出す決まり。

梱包材の在庫も、数えますか？

まだ使っていない包装材料は、棚卸しの対象。通常の年と比べて特に増えていなければ、省略しても差し支えありません。

棚卸しの結果を書く帳簿のつけ方は、こちらです。

まとめ

棚卸しは、12月31日の在庫を数えて金額にして、売上原価を決める作業。FBA在庫は在庫元帳レポート、手元は実際に数えて、棚卸表にまとめておきましょう。